廣州艾基生物技術有限公司
Guangzhou IGE Biotechnology Co., Ltd.
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服務介紹 Service Introduction
擴增子測序主要通過對特定長度的 PCR 產物進行測序分析，細菌的16S rRNA基因和真菌的ITS基因結構既具有保守性，又具有高變性。通過測序結果與數據庫比較，可以分析環境細菌/真菌的菌群結構和多樣性。針對環境樣本，16S/18S/ITS 等基因擴增子測序是研究環境微生物多樣 性及群落組成差異的重要技術手段之一。
提供的服務 Services
根據不同的研究目的和需求，我們提供 3 種擴增子產品：16S rDNA 測序、ITS 測序及目標區域擴增子測序。具體介紹如下：
1、16S rDNA 測序：16S rDNA 為編碼原核生物核糖體小亞基 rRNA 的 DNA 序列， 具有 10 個保守區域和 9 個高變區域（V1-V9），其中保守區在細菌間差異不大，高變區具有屬或種的特異性，對 16S rDNA 某個高變區進行測序，用于研究環境微生物中細菌或古菌的群 落結構多樣性。
2、ITS 測序：ITS 分為兩個區域：ITS1 和 ITS2，ITS1 位于真核生物 rDNA 序列 18S 和 5.8S 之間，ITS2 位于真核生物 rDNA 序列 5.8S 和 28S 之間。對 ITS1或 ITS2 進行測序，用于研究環境微生物中真菌群落結構多樣性。
3、目標區域擴增子測序：根據客戶的研究需求，利用第二代高通量測序技術，對某些目標基因的 PCR 產物提供測序及分析服務。
實驗流程
分析內容
樣品要求 Sample Requirements
送樣建議 | 送樣量 | 重復樣品數 | DNA總量 | DNA濃度 | DNA純度A260/A280 | DNA完整性 | PCR 產物 | |
腸道樣品 | 糞便 | ≥1g，至少大于500mg | 10-20個 | m≥0.25μg | c＞5ng/μl | 1.8~2.0 | DNA無降解，即電泳有明顯的主條帶 | 濃度 ≥ 20 ng/μl，總量 ≥ 400 ng，片段大小＜ 450 bp，條帶單一，無降解，無引物二聚體。 |
環境樣品 | 水體 | 50ml，推薦使用濾膜推注，2片以上 | 3-5個 | |||||
土壤樣品 | 土壤、淤泥 | ≥50g | 10個 | |||||
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