在研究基因轉錄調控的過程中，大家經?？吹綐嫿硞€基因啟動子的熒光素酶報告質粒或者預測與某基因啟動子結合的轉錄因子，無論哪種，首先得查找到某基因的啟動子序列。
        能查到啟動子序列的網站很多，pubmed，ensemble，UCSC 等等，那我們給大家介紹一下比較簡單容易上手的查找方式，例如非常強大的NCBI數據庫如何查找啟動子的詳細介紹，而promoter和TF的結合通過什么網站預測的呢？

基因啟動子序列查找步驟

1.打開NCBI https://www.ncbi.nlm.nih.gov/進入首頁，在①處下拉選擇gene，②處輸入基因名稱或ID編號，點擊Search進行查找。

2. 例：基因名稱：B4GALT1，物種：human。主要從名稱，ID號，物種，別稱等信息確定要查找的基因。

3.選擇點擊目的基因，檢查基因名稱及物種是否符合要求。

注意觀察啟動子的方向，點擊GenBank；

反向：

正向：

① 若為反向：將數值較大的數復制到

并+1得到新數值，將數值較大的數+2000后填入

，點擊下方Update View即可得到基因的啟動子序列。如下圖：

② 若為正向：將數值較小的數復制到

-1得到新數值，將較小的數值-2000填入

，點擊下方Update View即可得到基因的啟動子序列。

啟動子與轉錄因子結合位點預測

相關網站：http://jaspardev.genereg.net/ （2014版）

       http://jaspar.genereg.net/ （2020版）

1. 找出相關的啟動子的序列（方法如上）

2. 進入網站http://jaspardev.genereg.net/ （2014版），根據不同的物種選擇不同的分類，如下圖：

3. 以B4GALT1，Mus musculus為例：

選擇JASPAR CORE Vertebrata（脊椎動物）進入以下頁面，勾選所有物種為Mus musculus，在右側的空白框內輸入已找到的B4GALT1啟動子序列，點擊SCAN。

4. 該啟動子與轉錄因子結合位點預測的結果如圖所示：另存為該網頁，用word文檔打開即可。